262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1185 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1185  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
258 aa  501  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.149779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7934  protein of unknown function DUF45  63.19 
 
 
180 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8351  metal-dependent hydrolase-like protein  64.38 
 
 
171 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  63.75 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27520  predicted metal-dependent hydrolase  62.42 
 
 
203 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  67.61 
 
 
236 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3802  protein of unknown function DUF45  61.64 
 
 
191 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  59.76 
 
 
173 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0790  protein of unknown function DUF45  67.3 
 
 
184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3736  protein of unknown function DUF45  63.64 
 
 
174 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1523  hypothetical protein  61.44 
 
 
170 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4380  hypothetical protein  62.67 
 
 
178 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0720  protein of unknown function DUF45  54.78 
 
 
206 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  63.89 
 
 
208 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4114  hypothetical protein  61.38 
 
 
172 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26654  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3733  hypothetical protein  60.69 
 
 
172 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.586168  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  56.79 
 
 
201 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2474  protein of unknown function DUF45  54.59 
 
 
211 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000651268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  53.3 
 
 
241 aa  158  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0533  metal-dependent hydrolase  52.53 
 
 
210 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  53.05 
 
 
175 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2752  hypothetical protein  50 
 
 
211 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11430  predicted metal-dependent hydrolase  51.47 
 
 
220 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15040  predicted metal-dependent hydrolase  47.64 
 
 
222 aa  128  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0278  hypothetical protein  38.61 
 
 
164 aa  122  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19100  predicted metal-dependent hydrolase  43.67 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.155698  normal  0.193452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3889  hypothetical protein  53.73 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  47.5 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  28.25 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  45.57 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  42.86 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  41.43 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  42.72 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  39.45 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3318  hypothetical protein  49.25 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  41.75 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  43.3 
 
 
318 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  40.91 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  43.21 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  28.06 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  33.08 
 
 
184 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  39.67 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  37.61 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  38.46 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  39.8 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  37.93 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  37.76 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  27.69 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  39.8 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  50.88 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  37.93 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  30.83 
 
 
481 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  40.74 
 
 
279 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  50 
 
 
239 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  36.45 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  50.82 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  27.52 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  50.82 
 
 
316 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  45.31 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  45.71 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  35.87 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  39.62 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  50.82 
 
 
295 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  50.82 
 
 
295 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  29.85 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  37.93 
 
 
253 aa  58.9  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  50.82 
 
 
292 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  50.82 
 
 
295 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  37.93 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  50.82 
 
 
292 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  50.82 
 
 
292 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  50.82 
 
 
292 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  50.82 
 
 
292 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  50.82 
 
 
292 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  45.71 
 
 
278 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  50.82 
 
 
303 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  50.82 
 
 
292 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  50.82 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  54.1 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  54.1 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  51.56 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  50 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  30.91 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  46 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  43.4 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  40.74 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  50.75 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  45.31 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  50 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  54.1 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  24.06 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  44.83 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  28.16 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  43.4 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  41.18 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  38.46 
 
 
340 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  35.4 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>