199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3318 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3318  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  393  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3889  hypothetical protein  74.87 
 
 
196 aa  287  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0278  hypothetical protein  31.85 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2752  hypothetical protein  49.28 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4380  hypothetical protein  36.67 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  49.25 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4114  hypothetical protein  43.06 
 
 
172 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26654  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2474  protein of unknown function DUF45  45.59 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000651268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7934  protein of unknown function DUF45  44.12 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  46.58 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27520  predicted metal-dependent hydrolase  28.96 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0533  metal-dependent hydrolase  36.79 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0720  protein of unknown function DUF45  46.38 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3733  hypothetical protein  41.67 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.586168  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19100  predicted metal-dependent hydrolase  31.52 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.155698  normal  0.193452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1185  protein of unknown function DUF45  49.25 
 
 
258 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.149779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  39.13 
 
 
236 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3802  protein of unknown function DUF45  32.82 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8351  metal-dependent hydrolase-like protein  30.77 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1523  hypothetical protein  40.96 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11430  predicted metal-dependent hydrolase  27.63 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3736  protein of unknown function DUF45  39.73 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282728  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  35.29 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  41.79 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  26.47 
 
 
241 aa  58.2  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  34.51 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  34.51 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  26.13 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  37.97 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  40.3 
 
 
279 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  41.56 
 
 
266 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  38.81 
 
 
175 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  40.3 
 
 
249 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  34.62 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  30.08 
 
 
251 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  40 
 
 
242 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  47.46 
 
 
230 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  29.94 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  32.53 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  34.85 
 
 
481 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  40.3 
 
 
256 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  30.61 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  36.84 
 
 
278 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0330  hypothetical protein  26.87 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  40.3 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  35.06 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  22.7 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  35.9 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0790  protein of unknown function DUF45  41.67 
 
 
184 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  36.21 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  30.3 
 
 
320 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  31.43 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  44.07 
 
 
238 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  28.04 
 
 
222 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  31.34 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  43.28 
 
 
256 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  39.66 
 
 
222 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  35.42 
 
 
244 aa  52  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  31.88 
 
 
219 aa  51.6  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  36.21 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  30.67 
 
 
227 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  34.33 
 
 
251 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  22.41 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  29.33 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  26.03 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  36.36 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  27.96 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  37.93 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  44.64 
 
 
240 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  36.62 
 
 
245 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  36.59 
 
 
217 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  34.38 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  25.97 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  24.07 
 
 
226 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  35.82 
 
 
254 aa  48.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  25.37 
 
 
235 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1624  hypothetical protein  38.71 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.594523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  26.76 
 
 
235 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  38.98 
 
 
262 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  39.06 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  35.14 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  32.84 
 
 
252 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  26.06 
 
 
235 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  32.32 
 
 
286 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  26.06 
 
 
235 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  30.34 
 
 
295 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.48 
 
 
242 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  34.78 
 
 
258 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  40 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  30 
 
 
246 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2114  hypothetical protein  37.33 
 
 
104 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  26.06 
 
 
235 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  39.06 
 
 
233 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  34.33 
 
 
252 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  26.06 
 
 
235 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
241 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  39.06 
 
 
231 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>