241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2114 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2114  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  41.25 
 
 
244 aa  83.6  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  42.05 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  39.56 
 
 
227 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  42.17 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  49.45 
 
 
292 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  50 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  49.45 
 
 
292 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  47.25 
 
 
285 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  46.15 
 
 
300 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  36.08 
 
 
237 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  49.45 
 
 
286 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  38.46 
 
 
227 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  46.15 
 
 
300 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  49.44 
 
 
288 aa  80.1  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  41.94 
 
 
243 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  49.45 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  40.51 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  46.84 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  40.51 
 
 
224 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  40.96 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  47.3 
 
 
239 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  45.16 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  41.98 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  50 
 
 
228 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  48.31 
 
 
321 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  40.79 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  44.32 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  46.15 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  42.86 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  42.86 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  42.86 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  42.86 
 
 
316 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  42.86 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  42.86 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  42.86 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  39.13 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  42.86 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  42.86 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  48.72 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  42.86 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  42.86 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  37.65 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  45.24 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  46.05 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  37.21 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  42.86 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  42.86 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  42.86 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  42.86 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  44.9 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  42.5 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  47.67 
 
 
310 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  46.05 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  38.32 
 
 
270 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  49.37 
 
 
217 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  41.05 
 
 
278 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  45.45 
 
 
241 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  42.47 
 
 
244 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  36.78 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  35.71 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  38.75 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  40.62 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  35.05 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  49.33 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  41.67 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  43.18 
 
 
340 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  33.01 
 
 
227 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  44.87 
 
 
266 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  39.47 
 
 
237 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  70.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  35.29 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  37.86 
 
 
278 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  39.78 
 
 
198 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  40 
 
 
256 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  47.37 
 
 
320 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  38.95 
 
 
249 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  36.36 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  44.87 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  39 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  47.76 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  40.79 
 
 
481 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  40 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  43.01 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  43.01 
 
 
260 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  35.79 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  38.75 
 
 
251 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  39.53 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  47.44 
 
 
242 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  35.8 
 
 
252 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  43.02 
 
 
303 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  45.26 
 
 
241 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  41.25 
 
 
241 aa  67  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  48.44 
 
 
246 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  44.3 
 
 
236 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  48.44 
 
 
246 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  43.18 
 
 
308 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  35.8 
 
 
252 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  48.61 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  42.53 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>