210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0533 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0533  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3802  protein of unknown function DUF45  60.84 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  58.99 
 
 
213 aa  194  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8351  metal-dependent hydrolase-like protein  62.03 
 
 
171 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27520  predicted metal-dependent hydrolase  54.76 
 
 
203 aa  188  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7934  protein of unknown function DUF45  54.76 
 
 
180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3736  protein of unknown function DUF45  59.73 
 
 
174 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  58.14 
 
 
175 aa  171  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0790  protein of unknown function DUF45  57.32 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  46.39 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1523  hypothetical protein  54.66 
 
 
170 aa  160  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4380  hypothetical protein  56.71 
 
 
178 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  51.79 
 
 
201 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4114  hypothetical protein  56.02 
 
 
172 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26654  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3733  hypothetical protein  55.42 
 
 
172 aa  158  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.586168  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1185  protein of unknown function DUF45  51.39 
 
 
258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.149779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0720  protein of unknown function DUF45  44.72 
 
 
206 aa  152  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  46.06 
 
 
173 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  49.08 
 
 
241 aa  145  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  51.39 
 
 
208 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11430  predicted metal-dependent hydrolase  44.53 
 
 
220 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0278  hypothetical protein  41.56 
 
 
164 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2752  hypothetical protein  44.44 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2474  protein of unknown function DUF45  38.82 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000651268 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19100  predicted metal-dependent hydrolase  38.79 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.155698  normal  0.193452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15040  predicted metal-dependent hydrolase  38.25 
 
 
222 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3318  hypothetical protein  36.79 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  39.44 
 
 
227 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  39.05 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  38.03 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3889  hypothetical protein  30.06 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  29.49 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  36.45 
 
 
241 aa  58.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  40 
 
 
278 aa  58.2  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  38.83 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  35.04 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  30.56 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  40.66 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  43.08 
 
 
239 aa  55.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  34.17 
 
 
279 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  36.78 
 
 
249 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  39.76 
 
 
256 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  37.78 
 
 
278 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  39.76 
 
 
278 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  44.64 
 
 
184 aa  55.1  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  28.45 
 
 
249 aa  53.9  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  28.68 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  42.11 
 
 
262 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  31.88 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  40.58 
 
 
481 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  40.62 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  38.24 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  29.58 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  36.36 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  24.69 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  42.19 
 
 
261 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  35.24 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  36.14 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  37.5 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  47.17 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  38.3 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  29.77 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  36.36 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  42.86 
 
 
238 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  51.6  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  51.6  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  47.17 
 
 
202 aa  51.6  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  37.68 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  25.5 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  36.23 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  43.75 
 
 
286 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  31.17 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  45.28 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  44.44 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  30.39 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  34.58 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  39.71 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  36.23 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  36.23 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  37.31 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  36.23 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  28.7 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  28.7 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  37.68 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  35 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  40.58 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  37.31 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  36.23 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  35.85 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  43.75 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  37.31 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  39.13 
 
 
247 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  34.62 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  40.58 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  40.58 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  38.24 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  34.33 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  36.23 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>