210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0842 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0842  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0970  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473345  normal  0.177309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0312  protein of unknown function DUF45  70.48 
 
 
106 aa  157  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.137336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0338  protein of unknown function DUF45  72.73 
 
 
102 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.860406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0142  protein of unknown function DUF45  66.98 
 
 
107 aa  151  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596952  normal  0.717523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  42.86 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  42.86 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1155  metal-dependent hydrolase-like  45.05 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439664  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1808  protein of unknown function DUF45  45.35 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4387  hypothetical protein  46.99 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177424  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0228  hypothetical protein  40.91 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0259  hypothetical protein  39.77 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1669  metal-dependent hydrolase-like  42.68 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000580277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2686  hypothetical protein  45 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1091  protein of unknown function DUF45  40.96 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00838265  normal  0.159075 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1174  hypothetical protein  42.5 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3111  metal-dependent hydrolase  40 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1569  hypothetical protein  38.64 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184826  unclonable  0.0000116524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  37.65 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  39.33 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  34.07 
 
 
225 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  37.11 
 
 
223 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  35.96 
 
 
224 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  35.71 
 
 
224 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  34.02 
 
 
253 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  33.02 
 
 
229 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  38.2 
 
 
254 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  31.91 
 
 
236 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1899  hypothetical protein  35.37 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  36.36 
 
 
246 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
244 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  34.09 
 
 
239 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  30.61 
 
 
244 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  36.99 
 
 
227 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  41.94 
 
 
245 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  35.37 
 
 
243 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1094  protein of unknown function DUF45  35.71 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  50 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  32.89 
 
 
279 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  35.9 
 
 
242 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  32.65 
 
 
230 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  31.03 
 
 
198 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  34.15 
 
 
243 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  31.71 
 
 
240 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  31.46 
 
 
261 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  32.58 
 
 
223 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  36.99 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  31.25 
 
 
251 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  31.25 
 
 
278 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  32.05 
 
 
278 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  33.72 
 
 
239 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  41.1 
 
 
243 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  30.11 
 
 
179 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  31.58 
 
 
278 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  32.93 
 
 
262 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  27 
 
 
247 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  32.22 
 
 
340 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  32.43 
 
 
256 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  32.18 
 
 
202 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  32.89 
 
 
198 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  33.7 
 
 
226 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.74 
 
 
234 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  32.18 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  31.65 
 
 
230 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.87 
 
 
241 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  32.56 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  34.85 
 
 
232 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  38.24 
 
 
243 aa  50.4  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  37.29 
 
 
240 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  26.88 
 
 
245 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  31.91 
 
 
240 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  35.53 
 
 
233 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  45.28 
 
 
249 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  32.86 
 
 
260 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  26.04 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  31.87 
 
 
259 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  23.96 
 
 
215 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  33.73 
 
 
263 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.21 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  32 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  27.96 
 
 
242 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  32.22 
 
 
314 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  31.33 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  24.14 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  37.31 
 
 
234 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  30.12 
 
 
251 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  30.26 
 
 
249 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  30 
 
 
321 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  27.96 
 
 
320 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  29.13 
 
 
237 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  31.76 
 
 
245 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  29.79 
 
 
211 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  32.91 
 
 
244 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  42.86 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  34.29 
 
 
254 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  30.12 
 
 
252 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  38.36 
 
 
247 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>