250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3111 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3111  metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 120 aa  246  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1174  hypothetical protein  86.67 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1569  hypothetical protein  80.61 
 
 		 103 aa  178  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184826  unclonable  0.0000116524 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0259  hypothetical protein  75 
 
 		 149 aa  169  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0228  hypothetical protein  75 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4387  hypothetical protein  53.01 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177424  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1808  protein of unknown function DUF45  51.81 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0312  protein of unknown function DUF45  42.22 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.137336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2686  hypothetical protein  48.19 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1669  metal-dependent hydrolase-like  48.1 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000580277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  40 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  40 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0338  protein of unknown function DUF45  39.18 
 
 		 102 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.860406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0142  protein of unknown function DUF45  39.36 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596952  normal  0.717523 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1899  hypothetical protein  43.18 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1155  metal-dependent hydrolase-like  40.66 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0842  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0970  protein of unknown function DUF45  40 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473345  normal  0.177309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  40.48 
 
 		 246 aa  72  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  43.37 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1091  protein of unknown function DUF45  45.07 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00838265  normal  0.159075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1094  protein of unknown function DUF45  48.05 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  31.87 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  43.08 
 
 		 242 aa  67  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  44.16 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  39.08 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  41.03 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  43.94 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  43.84 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  37.97 
 
 		 258 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  36.47 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  38.37 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  37.14 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  41.54 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  27.96 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  39.73 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  35.53 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  33.75 
 
 		 249 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  29.21 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  37.33 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  32.91 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  34.88 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  41.94 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  36.62 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  41.1 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  34.12 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  37.66 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  36.11 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  31.17 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  38.46 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  34.25 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  36.47 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  42.25 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  34.21 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  34.09 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  39.68 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  32.58 
 
 		 243 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  35.62 
 
 		 251 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  34.83 
 
 		 236 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  34.38 
 
 		 222 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  35 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  37.5 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  44.62 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  35.06 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  37.08 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  36.25 
 
 		 223 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  33.85 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  28.87 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  33.85 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  34.38 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.09 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  35.37 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  35.38 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  37.18 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  27.27 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  32.88 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  37.66 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  34.72 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  34.92 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  32.43 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  38.24 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  32.98 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.72 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  36.9 
 
 		 285 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  27.66 
 
 		 235 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  31.82 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  36.67 
 
 		 259 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  31.65 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  34.52 
 
 		 259 aa  53.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>