More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3930 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
282 aa  542  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  74.91 
 
 
280 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  43.68 
 
 
280 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 
279 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  35.69 
 
 
267 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  35.34 
 
 
267 aa  149  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 
267 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  48.57 
 
 
281 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.14 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.03 
 
 
341 aa  132  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  41.15 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  47.14 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  43.26 
 
 
262 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
260 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  32.75 
 
 
271 aa  129  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.27 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 
310 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  34.74 
 
 
261 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  46.38 
 
 
242 aa  125  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  29.43 
 
 
282 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  31.18 
 
 
259 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.83 
 
 
263 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
263 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  32.4 
 
 
281 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.13 
 
 
266 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  28.25 
 
 
306 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  29.63 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  49.11 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  34.41 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  31.55 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.69 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  41.54 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
285 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  31.07 
 
 
277 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
258 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  31.21 
 
 
269 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  48.18 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  28.22 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  35.96 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  47.5 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  28.22 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  30.53 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  42.66 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  28.98 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  34.05 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  41.58 
 
 
283 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  42.67 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
280 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  52.71 
 
 
260 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 
274 aa  112  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 
332 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1045  phosphatidate cytidylyltransferase  34.02 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.447083  normal  0.0440857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  46.04 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  46.04 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  46.04 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  40.33 
 
 
296 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
272 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  45.65 
 
 
285 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  31.47 
 
 
279 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  43.62 
 
 
271 aa  109  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  30.58 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
285 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 
285 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 
285 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
273 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 
285 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  47.52 
 
 
236 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  33.81 
 
 
301 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 
285 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  48.51 
 
 
254 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>