More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0717 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.17 
 
 
608 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.3 
 
 
651 aa  870    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.52 
 
 
643 aa  784    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 
615 aa  638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
638 aa  1285    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.19 
 
 
639 aa  651    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.55 
 
 
656 aa  977    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.96 
 
 
611 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.53 
 
 
604 aa  657    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  96.39 
 
 
640 aa  1241    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  53.85 
 
 
614 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.11 
 
 
613 aa  632  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.96 
 
 
620 aa  632  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  61.6 
 
 
627 aa  632  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.29 
 
 
645 aa  633  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  53.82 
 
 
613 aa  628  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.21 
 
 
616 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  53.23 
 
 
613 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.89 
 
 
657 aa  631  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.55 
 
 
608 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.75 
 
 
602 aa  628  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.53 
 
 
616 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  62.17 
 
 
499 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.28 
 
 
676 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.01 
 
 
612 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.71 
 
 
651 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  52.92 
 
 
613 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.03 
 
 
635 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.02 
 
 
640 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  52.2 
 
 
641 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  52.79 
 
 
681 aa  618  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.19 
 
 
632 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.86 
 
 
612 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.46 
 
 
637 aa  618  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.33 
 
 
643 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.32 
 
 
645 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  53.21 
 
 
639 aa  612  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  53.21 
 
 
639 aa  612  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  51.47 
 
 
617 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  51.27 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.82 
 
 
648 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.98 
 
 
607 aa  614  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.13 
 
 
616 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  52.22 
 
 
643 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.7 
 
 
612 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  50.99 
 
 
612 aa  613  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.77 
 
 
599 aa  614  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 
643 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.13 
 
 
616 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  52.3 
 
 
644 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.3 
 
 
647 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  52.3 
 
 
644 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  51.27 
 
 
644 aa  611  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  52.3 
 
 
644 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 
650 aa  608  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 
653 aa  608  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  52.3 
 
 
647 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  51.1 
 
 
647 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  51.1 
 
 
647 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  52.3 
 
 
647 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  58.27 
 
 
617 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  52.3 
 
 
644 aa  610  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  51.11 
 
 
647 aa  609  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  52.07 
 
 
659 aa  611  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  50 
 
 
651 aa  609  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  51.1 
 
 
647 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  57.88 
 
 
617 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  51.1 
 
 
647 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
621 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.46 
 
 
764 aa  610  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  52.3 
 
 
647 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.09 
 
 
608 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  50.31 
 
 
658 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  51.97 
 
 
638 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  51.22 
 
 
660 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.12 
 
 
636 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  51.89 
 
 
626 aa  606  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  50.94 
 
 
647 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.31 
 
 
639 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.48 
 
 
640 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.66 
 
 
646 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  54.2 
 
 
645 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  60.4 
 
 
602 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.76 
 
 
651 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.08 
 
 
655 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  52.97 
 
 
693 aa  606  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  50.79 
 
 
637 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.97 
 
 
641 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.42 
 
 
630 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 
650 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  52.14 
 
 
647 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.76 
 
 
640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.55 
 
 
640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.28 
 
 
644 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  59.3 
 
 
645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  59.16 
 
 
619 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  50.89 
 
 
649 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.83 
 
 
652 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.4 
 
 
673 aa  603  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.03 
 
 
645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>