141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0384 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  99.19 
 
 
248 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  87.9 
 
 
248 aa  440  1e-122  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  63.86 
 
 
251 aa  318  7e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  64.9 
 
 
249 aa  305  4e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  60 
 
 
247 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  59.04 
 
 
249 aa  273  2e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 
256 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  47.84 
 
 
265 aa  214  1e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  51.25 
 
 
257 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  47.81 
 
 
255 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  48.64 
 
 
261 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  46.8 
 
 
259 aa  200  1e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  50.6 
 
 
252 aa  200  2e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  51.72 
 
 
252 aa  199  2e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  47.54 
 
 
290 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  51.05 
 
 
271 aa  199  4e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  45.56 
 
 
263 aa  199  4e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  49.79 
 
 
265 aa  199  4e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  48.05 
 
 
257 aa  199  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  50.43 
 
 
252 aa  197  1e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  47.95 
 
 
244 aa  196  2e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  50.21 
 
 
283 aa  196  4e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  45.31 
 
 
647 aa  196  4e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  45.82 
 
 
261 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  49.61 
 
 
264 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  42.23 
 
 
272 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  46.48 
 
 
258 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  48.89 
 
 
264 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  41.67 
 
 
274 aa  189  3e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  43.85 
 
 
257 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  41.57 
 
 
277 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 
265 aa  178  6e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  40.93 
 
 
259 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  36.71 
 
 
253 aa  177  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  34.57 
 
 
260 aa  177  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  44.16 
 
 
269 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  36.02 
 
 
257 aa  172  4e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 
254 aa  172  7e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  44.49 
 
 
272 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  37.25 
 
 
279 aa  159  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  42.42 
 
 
248 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  32.05 
 
 
276 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.40392e-07  hitchhiker  9.02529e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  32.05 
 
 
276 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.44 
 
 
259 aa  62  8e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  40.66 
 
 
239 aa  61.6  1e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.35 
 
 
274 aa  59.7  5e-08  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  28.34 
 
 
413 aa  57.4  2e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  30.93 
 
 
237 aa  57  3e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.91 
 
 
258 aa  54.7  1e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.55 
 
 
261 aa  55.1  1e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  29.32 
 
 
246 aa  55.1  1e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
275 aa  54.3  2e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
286 aa  53.5  3e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.43 
 
 
370 aa  53.1  4e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  27.32 
 
 
259 aa  52.4  7e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  23.76 
 
 
260 aa  51.6  1e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.26151e-06  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30.21 
 
 
257 aa  50.8  2e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34489  predicted protein  23.88 
 
 
280 aa  50.4  3e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  25.61 
 
 
268 aa  50.4  3e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  24.17 
 
 
251 aa  49.7  5e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
256 aa  49.3  6e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.55 
 
 
371 aa  49.3  6e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.11 
 
 
254 aa  48.9  8e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
278 aa  48.5  9e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  21.65 
 
 
273 aa  48.5  9e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  23.11 
 
 
336 aa  48.5  9e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  24.59 
 
 
408 aa  48.5  9e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  21.8 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  31.12 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  24.52 
 
 
415 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.34708e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.76 
 
 
370 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.69 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.5 
 
 
368 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.29 
 
 
374 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  37.18 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  24.03 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  29.58 
 
 
412 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  27.7 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 
368 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 
368 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
280 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  23.41 
 
 
405 aa  45.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.83 
 
 
274 aa  45.4  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.37661e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
284 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  27.15 
 
 
407 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  34.18 
 
 
402 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
369 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
369 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
369 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.59 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  31.35 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.59 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  24.76 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  23.93 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  27.31 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>