68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0176 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  84.68 
 
 		 219 aa  362  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  86.78 
 
 		 221 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  80.53 
 
 		 225 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  77.01 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  68.16 
 
 		 225 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  74.43 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  50.28 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  37.86 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  35.29 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  38.71 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  40 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  38.15 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  39.74 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  31.09 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  37.77 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  36.04 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  37.58 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  36.25 
 
 		 186 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  36.32 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  36.41 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  37.91 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  37.33 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  36.7 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  37.01 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.69 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  33.76 
 
 		 160 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  33.55 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  33.55 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  32.67 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  34.19 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  29.77 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  32.24 
 
 		 170 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  29.83 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  30.82 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.25 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  30.37 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  30.57 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  31.36 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  30.57 
 
 		 181 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  29.61 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  39.74 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.45 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  31.97 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  28.48 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  35.71 
 
 		 362 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  24.74 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  27.87 
 
 		 167 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  22.64 
 
 		 170 aa  52  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.16 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  26.25 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  27.38 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  29.51 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  26.47 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.73 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.73 
 
 		 162 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  27.69 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  27.22 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.84 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  26.01 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  24.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  24.65 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  25.83 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  40.43 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  24.6 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1507  OstA family protein  25.64 
 
 		 196 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  decreased coverage  0.000611674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  43.18 
 
 		 182 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  23.91 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>