47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2341 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  100 
 
 		 191 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  57.05 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  49.68 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  35.54 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  31.21 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  33.14 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  28.02 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  41.53 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  35.25 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  35.25 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  28.67 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  27.75 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  29.83 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  30.91 
 
 		 242 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  27.86 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  30.18 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  28.19 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  29.59 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  34.45 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  35.25 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  30.06 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  31.76 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  26.51 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  30.83 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  32.76 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  26.15 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  27.34 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  27.7 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  27.7 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  22.81 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.69 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  33.06 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  24.16 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  24.29 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  40.96 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  29.5 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  26.73 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  23.26 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2890  OstA family protein  26.02 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.745795  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  25.2 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  28.48 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  22.81 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.19 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  25.29 
 
 		 323 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  20.75 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  27.41 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  23.58 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>