23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0012 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  35.64 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  31.22 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  32.24 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  31.36 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  30.72 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  31.25 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  30.97 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  33.33 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  34.65 
 
 		 169 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  31.08 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  29.56 
 
 		 167 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  29.2 
 
 		 200 aa  49.3  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  28.12 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  27.33 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.41 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  33.33 
 
 		 162 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  24.14 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  28.95 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  26.8 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  32.35 
 
 		 196 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  27.78 
 
 		 242 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  37.37 
 
 		 186 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>