57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0152 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  44 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1769  hypothetical protein  38.92 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1507  OstA family protein  44.31 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  decreased coverage  0.000611674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  38.3 
 
 		 224 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.79 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  28.74 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  31.25 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.5 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  31.13 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  29.88 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  29.85 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  33.11 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  33.11 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  28.57 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  30.34 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  28.12 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  26.67 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  30.61 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  27.88 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  26.6 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  25.83 
 
 		 227 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  26.58 
 
 		 228 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  24.46 
 
 		 189 aa  50.8  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  23.35 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  24.86 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  27.33 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  28.49 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1660  OstA-like protein  28.93 
 
 		 760 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  28.29 
 
 		 230 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  27.16 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  25.14 
 
 		 198 aa  47.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.16 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.16 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.16 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.16 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.16 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.16 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.16 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.16 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1280  hypothetical protein  25.16 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000165171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  26.09 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  27.67 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  24.7 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1940  hypothetical protein  32.14 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.946021  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2107  hypothetical protein  28.74 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4207  OstA family protein  26.44 
 
 		 186 aa  44.3  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.283739  normal  0.860809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  25.85 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  24.31 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  25.85 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.31 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.31 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.31 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.43 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.31 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.31 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.06 
 
 		 202 aa  40.8  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>