25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1507 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1507  OstA family protein  100 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  decreased coverage  0.000611674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  49 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1769  hypothetical protein  45.34 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  44.31 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  39.43 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  28.07 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  26.95 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  28.67 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.16 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  25.29 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1660  OstA-like protein  28.26 
 
 		 760 aa  62  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  25.87 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.05 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  22.47 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.78 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1940  hypothetical protein  28.21 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.946021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4169  hypothetical protein  28.75 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  28.28 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  27.34 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4300  OstA family protein  29.05 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4322  OstA family protein  29.05 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  25.64 
 
 		 221 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  24.72 
 
 		 216 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  25.62 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  20.97 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>