46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2905 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  100 
 
 		 173 aa  339  9e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  52.34 
 
 		 191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  46.34 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  29.77 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  32.31 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  31.74 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  30.58 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  28.08 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  34.31 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  32.21 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  34.31 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  30.6 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  30.6 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  29.32 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  29.32 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  33.1 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  29.83 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  27.43 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  27.39 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  29.56 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  32.92 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  32.12 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  25.18 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  27.95 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  35.07 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  30.6 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  31.71 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  25.18 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  29.25 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  24.52 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  26.38 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  23.9 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  24.53 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  27.59 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  29.41 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  29.93 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  26.19 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2224  OstA-like protein  45.9 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  26.15 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  32.38 
 
 		 285 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  45.28 
 
 		 275 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  28.83 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.48 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  29.07 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0645  hypothetical protein  23.57 
 
 		 238 aa  41.2  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0164961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  23.98 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>