50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3669 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  43.71 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  35.5 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  44.67 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  39.26 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  38.65 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  38.46 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  40.61 
 
 		 216 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  35.08 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  39.43 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  39.16 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  36.41 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  37.7 
 
 		 225 aa  95.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  37.8 
 
 		 221 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  37.35 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  38.92 
 
 		 225 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  34.18 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  38.84 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  30.3 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  27.78 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  31.65 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  27.84 
 
 		 242 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  30.16 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  28.49 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  30.3 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  31.25 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  31.94 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  29.45 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  29.45 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.21 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  31.2 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  28.31 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  30.92 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  29.53 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  30.5 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  40.66 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  25 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  23.57 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  26.39 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  32.67 
 
 		 362 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  30.67 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  27.81 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  28.76 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  21.55 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  22.73 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  26.25 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  22.53 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  37.37 
 
 		 323 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.14 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  23.61 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>