50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0046 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  88.73 
 
 		 204 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  55.56 
 
 		 186 aa  188  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  56.98 
 
 		 187 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  44.04 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  42.31 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  46.93 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  37.69 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  39.6 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  39.06 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  35.14 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  37.1 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  35 
 
 		 228 aa  101  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  37.81 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  38.75 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  37.85 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  38.75 
 
 		 227 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  32.2 
 
 		 239 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  34.78 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  34.16 
 
 		 246 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  34.39 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  33.13 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  28.39 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  29.22 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  27.01 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  29.38 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  26.32 
 
 		 163 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  26.32 
 
 		 163 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  28.06 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  29.34 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  26.21 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  32.28 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.56 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  36.17 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  26.75 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  24.73 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  29.12 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  25.29 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  25.79 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  27.4 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  25.67 
 
 		 169 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  30.34 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.02 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.06 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  22.16 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  29.53 
 
 		 323 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  25.58 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.91 
 
 		 179 aa  42  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2228  OstA family protein  28 
 
 		 175 aa  41.6  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  32.63 
 
 		 174 aa  41.6  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>