41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1603 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  44 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  34.45 
 
 		 224 aa  117  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1507  OstA family protein  39.43 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  decreased coverage  0.000611674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1769  hypothetical protein  35.67 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  31.82 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.54 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  31.82 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  28.83 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  28.39 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  30.57 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.16 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.26 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.76 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  29.11 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  27.98 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  27.56 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  30.2 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  25.68 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  27.27 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  25.93 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1940  hypothetical protein  35.53 
 
 		 166 aa  51.2  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.946021  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  25.31 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  27.56 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  25.85 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.85 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  21.68 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  24.85 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  26.49 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  26.09 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  26.49 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  24.84 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  25.81 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  25.83 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  26.95 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  26.95 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  24.86 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  25.55 
 
 		 212 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  29.25 
 
 		 230 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  24.44 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>