23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0336 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  100 
 
 		 362 aa  724    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  42.14 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  32.03 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  32.69 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  27.85 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  27.63 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  28.65 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  28.9 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  29.41 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  35.63 
 
 		 223 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  24.22 
 
 		 200 aa  53.5  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  38.2 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  36.45 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  36.45 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  36.84 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  25.49 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  32.67 
 
 		 186 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  31.87 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  26.74 
 
 		 216 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.29 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  27.81 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  25.88 
 
 		 196 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  20.65 
 
 		 545 aa  42.7  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>