29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0508 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  31.25 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  34.44 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.46 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  30.46 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  27.22 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  30.67 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  31.62 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  29.19 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  29.33 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  24.85 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  30.19 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  30.19 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  28.38 
 
 		 170 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.14 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  33.04 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  27.22 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  22.29 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.47 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  29.57 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  25.79 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  30.43 
 
 		 250 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  27.85 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  29.41 
 
 		 239 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  26.14 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  29.73 
 
 		 242 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  29.25 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  28.67 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  29.25 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>