132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4614 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.5 
 
 		 212 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.9 
 
 		 211 aa  222  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.57 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.91 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.62 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.37 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.57 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.32 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.04 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.47 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.92 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.42 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.42 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.43 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.8 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.98 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  32.34 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  32.12 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  32.12 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.08 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  27.75 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  31.61 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 331 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.46 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.48 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  26.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  28.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  28.43 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.06 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  29.24 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.3 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.61 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.49 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.55 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.45 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.82 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.45 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1723  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.348388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.37 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.48 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.92 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.92 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.89 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  29.7 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.99 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  30.15 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  26.43 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.48 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.42 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.74 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.19 
 
 		 375 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.74 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.78 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.94 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.24 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.68 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.05 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.23 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.75 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.48 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.33 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  23.57 
 
 		 401 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  21.69 
 
 		 411 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.13 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  24.31 
 
 		 417 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  24.85 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  25.69 
 
 		 401 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.84 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  25.34 
 
 		 402 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.56 
 
 		 406 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  26.76 
 
 		 360 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.14 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0179  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.06 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  26 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.29 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.43 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.79 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  29.38 
 
 		 182 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.86 
 
 		 342 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0257  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.39 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.31 
 
 		 369 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.27 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  24.64 
 
 		 375 aa  48.9  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  32.5 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.87 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.24 
 
 		 370 aa  48.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  34.12 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>