More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4368 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 371 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  79.5 
 
 		 367 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  79.17 
 
 		 376 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  77.81 
 
 		 349 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  76.16 
 
 		 392 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  78.72 
 
 		 357 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  70.18 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  58.42 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  61.11 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  60.23 
 
 		 441 aa  381  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  60.28 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  60.06 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  60.06 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  59.78 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.04 
 
 		 374 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  61.54 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  54.95 
 
 		 615 aa  362  8e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  55.27 
 
 		 358 aa  356  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  53.89 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  54.99 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  56.73 
 
 		 383 aa  352  8.999999999999999e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  54.37 
 
 		 365 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  54.78 
 
 		 370 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  54.44 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  55.52 
 
 		 364 aa  338  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.17 
 
 		 350 aa  329  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.28 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  52.49 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.49 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  49.71 
 
 		 350 aa  308  6.999999999999999e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.33 
 
 		 359 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  51.61 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  53.91 
 
 		 354 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.44 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.33 
 
 		 359 aa  295  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.56 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  48.7 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  52.52 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  52.33 
 
 		 350 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  50.15 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  49.42 
 
 		 333 aa  279  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.35 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  44.05 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.24 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  41.04 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 		 368 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.01 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  46.5 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  46.5 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  46.5 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  46.18 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  46.18 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  46.18 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  40.85 
 
 		 370 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  46.18 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.55 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  38.99 
 
 		 369 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.63 
 
 		 363 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  35.73 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  39.68 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.57 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  37.39 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39.89 
 
 		 353 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.94 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  37.07 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  41.16 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  35.94 
 
 		 345 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  35.41 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  35.94 
 
 		 345 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.31 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  39.17 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  41.9 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  39.61 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  39.61 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  39.61 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  39.29 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  39.61 
 
 		 350 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  39.61 
 
 		 350 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  34.1 
 
 		 347 aa  216  7e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  39.61 
 
 		 350 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  39.29 
 
 		 350 aa  216  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  36.26 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  39.61 
 
 		 350 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.71 
 
 		 368 aa  215  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  36.6 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  35.13 
 
 		 352 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.81 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  39.03 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  38.16 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  37.91 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  38.12 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.68 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  39.35 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  38.11 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  39.35 
 
 		 350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  38.12 
 
 		 350 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  42.48 
 
 		 330 aa  212  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  38.76 
 
 		 372 aa  212  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>