234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4459 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  51.64 
 
 		 725 aa  717    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  48.64 
 
 		 739 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 725 aa  1468    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  68.24 
 
 		 728 aa  945    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  69.17 
 
 		 729 aa  978    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  62.61 
 
 		 731 aa  877    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  75.52 
 
 		 730 aa  1118    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  98.48 
 
 		 725 aa  1447    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  47.49 
 
 		 736 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  62.89 
 
 		 731 aa  889    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  55.38 
 
 		 731 aa  791    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 725 aa  1468    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  56.13 
 
 		 732 aa  791    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  96.28 
 
 		 725 aa  1397    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  46.82 
 
 		 734 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  47.08 
 
 		 733 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  47.08 
 
 		 733 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  47.74 
 
 		 744 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  47.44 
 
 		 734 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  47.36 
 
 		 734 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  47.36 
 
 		 734 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  48.73 
 
 		 733 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  47.86 
 
 		 733 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  48.51 
 
 		 733 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  48.51 
 
 		 733 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  48.51 
 
 		 733 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  48.51 
 
 		 733 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  48.51 
 
 		 733 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  48.51 
 
 		 733 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  48.51 
 
 		 733 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  40.86 
 
 		 726 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  41.26 
 
 		 722 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  41.04 
 
 		 727 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  41.04 
 
 		 727 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  40.79 
 
 		 726 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  41.18 
 
 		 727 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  40.39 
 
 		 726 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  40.93 
 
 		 727 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  40.68 
 
 		 727 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  39.83 
 
 		 745 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  39.83 
 
 		 745 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  39.83 
 
 		 745 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  39.83 
 
 		 745 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  39.83 
 
 		 745 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  40.17 
 
 		 745 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  40.17 
 
 		 743 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  39.44 
 
 		 727 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  33.9 
 
 		 726 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  31.53 
 
 		 728 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  30.3 
 
 		 727 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1863  hypothetical protein  43.22 
 
 		 411 aa  277  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  27.49 
 
 		 750 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.6 
 
 		 664 aa  180  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  25.79 
 
 		 676 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  26.59 
 
 		 700 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  28.04 
 
 		 676 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  28.67 
 
 		 679 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  28.66 
 
 		 679 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.15 
 
 		 673 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.15 
 
 		 673 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.15 
 
 		 673 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.27 
 
 		 662 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  28.25 
 
 		 662 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  29.04 
 
 		 676 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.48 
 
 		 676 aa  157  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25.36 
 
 		 670 aa  154  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.03 
 
 		 672 aa  151  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.41 
 
 		 688 aa  150  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.23 
 
 		 670 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.6 
 
 		 662 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  39.17 
 
 		 664 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  24.88 
 
 		 690 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.5 
 
 		 692 aa  144  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 		 662 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  24.33 
 
 		 698 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  28.02 
 
 		 711 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.95 
 
 		 702 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  29.04 
 
 		 679 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.89 
 
 		 697 aa  140  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.15 
 
 		 741 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  25.66 
 
 		 713 aa  138  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  27.53 
 
 		 679 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  26.39 
 
 		 718 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.51 
 
 		 742 aa  135  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  25.75 
 
 		 714 aa  135  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.23 
 
 		 653 aa  134  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.11 
 
 		 680 aa  133  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.16 
 
 		 724 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.75 
 
 		 653 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.92 
 
 		 679 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.71 
 
 		 678 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.1 
 
 		 704 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  27.26 
 
 		 699 aa  129  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.76 
 
 		 700 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  25.23 
 
 		 687 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  25.54 
 
 		 681 aa  126  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  25.71 
 
 		 659 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.2 
 
 		 699 aa  125  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  32.88 
 
 		 724 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  28.45 
 
 		 700 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>