More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1193 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  91.38 
 
 		 232 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  90.95 
 
 		 232 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  90.95 
 
 		 232 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  75.64 
 
 		 240 aa  344  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  75.44 
 
 		 247 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  75 
 
 		 247 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  72.34 
 
 		 236 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  71.06 
 
 		 236 aa  327  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  72.88 
 
 		 249 aa  321  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 		 239 aa  318  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  67.81 
 
 		 244 aa  311  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  65.95 
 
 		 238 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  67.25 
 
 		 238 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  67.1 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  65.52 
 
 		 238 aa  308  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  58.67 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0437  response regulator receiver protein  52.4 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  231  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  51.75 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 232 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  52.17 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 237 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2206  two component transcriptional regulator  50.62 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  50 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 235 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  49.57 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  49.79 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  49.56 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  45.5 
 
 		 236 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3280  DNA-binding response regulator  47.75 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000001291  hitchhiker  0.0000698043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  48.1 
 
 		 245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  46.43 
 
 		 234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.98 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.27 
 
 		 229 aa  211  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4408  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  49.79 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  51.08 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  46.31 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  49.35 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  49.35 
 
 		 245 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  49.35 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  49.35 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  49.35 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  49.35 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3065  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00140102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  43.1 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  49.56 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.92 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  49.57 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.7 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2580  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.06 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 240 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2275  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.06 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0097  hypothetical protein  45.98 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0268047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  47.6 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>