70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0682 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  752    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  53.8 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  52.1 
 
 		 369 aa  352  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  47.11 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  42.15 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  37.32 
 
 		 366 aa  228  9e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  39.44 
 
 		 353 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  31.29 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  28.45 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 650 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  30 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  26.08 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  29.91 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  27.34 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  31.95 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  29.3 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  27.88 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  32.68 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  31.2 
 
 		 638 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  31.37 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  31.37 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 539 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  28.11 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  27.92 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  27.92 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  30.04 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  31.11 
 
 		 617 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  30.8 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  28.7 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  29.46 
 
 		 406 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  31.03 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  26.96 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  29.19 
 
 		 470 aa  82.8  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  30.13 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  27.43 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  26.71 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  29.84 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  28.1 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  26.84 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  25.76 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  29.51 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  30 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  31.64 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  24 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  24.48 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  24.26 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  21.4 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  27.68 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  28.3 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  28.32 
 
 		 589 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  32.7 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  21.21 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  28.08 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  23.22 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  28 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  23.84 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  28.89 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  28.99 
 
 		 159 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  26.77 
 
 		 178 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  25.1 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  20.87 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  36.76 
 
 		 499 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  35.05 
 
 		 135 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  32.84 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  24.44 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  26.45 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  32.98 
 
 		 705 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  29.47 
 
 		 548 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  35.44 
 
 		 646 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>