More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0509 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  54.31 
 
 		 840 aa  918    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  54.76 
 
 		 843 aa  954    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  47.65 
 
 		 851 aa  793    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  54.89 
 
 		 876 aa  932    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  52.71 
 
 		 830 aa  879    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  52.76 
 
 		 830 aa  883    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  59.81 
 
 		 838 aa  1019    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  100 
 
 		 843 aa  1715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  37.76 
 
 		 822 aa  552  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  35.18 
 
 		 846 aa  546  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  36.01 
 
 		 832 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.08 
 
 		 956 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.11 
 
 		 944 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  35.52 
 
 		 709 aa  437  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  38.67 
 
 		 659 aa  433  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.98 
 
 		 934 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.43 
 
 		 927 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.52 
 
 		 960 aa  405  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.6 
 
 		 930 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  36.62 
 
 		 661 aa  394  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  36.51 
 
 		 674 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.55 
 
 		 921 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.18 
 
 		 921 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.74 
 
 		 952 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  35.2 
 
 		 729 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  31.92 
 
 		 667 aa  357  5.999999999999999e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  32.47 
 
 		 929 aa  350  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  35.8 
 
 		 698 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  32.83 
 
 		 658 aa  347  8e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  34.86 
 
 		 633 aa  340  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  32.8 
 
 		 646 aa  340  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  33.47 
 
 		 743 aa  339  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.81 
 
 		 934 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  34.27 
 
 		 631 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  33.97 
 
 		 633 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  34.64 
 
 		 640 aa  337  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.81 
 
 		 934 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.01 
 
 		 934 aa  337  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.01 
 
 		 934 aa  336  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.67 
 
 		 934 aa  336  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.01 
 
 		 934 aa  336  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.01 
 
 		 934 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.01 
 
 		 934 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  32.92 
 
 		 725 aa  334  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  33.16 
 
 		 754 aa  333  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.31 
 
 		 934 aa  331  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.17 
 
 		 934 aa  330  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  33.57 
 
 		 647 aa  329  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  32.96 
 
 		 725 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  32.96 
 
 		 643 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  33.24 
 
 		 713 aa  328  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  33.05 
 
 		 636 aa  328  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.39 
 
 		 929 aa  328  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  31.87 
 
 		 646 aa  327  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  30.83 
 
 		 707 aa  324  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  34.15 
 
 		 651 aa  323  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.19 
 
 		 641 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  32.34 
 
 		 653 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  32.48 
 
 		 640 aa  317  6e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  34.87 
 
 		 664 aa  310  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.53 
 
 		 646 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  31.53 
 
 		 646 aa  308  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  32.46 
 
 		 668 aa  306  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.54 
 
 		 921 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.05 
 
 		 644 aa  305  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  33.33 
 
 		 639 aa  304  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  33.33 
 
 		 658 aa  303  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  34.75 
 
 		 645 aa  301  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  30.7 
 
 		 751 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  32.56 
 
 		 652 aa  300  9e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.4 
 
 		 909 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  32.42 
 
 		 652 aa  299  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  30.08 
 
 		 755 aa  299  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  32.73 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  30.14 
 
 		 662 aa  294  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  31.05 
 
 		 641 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  29.56 
 
 		 681 aa  293  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  32.62 
 
 		 639 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.69 
 
 		 691 aa  283  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  32.54 
 
 		 691 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.83 
 
 		 978 aa  280  9e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.8 
 
 		 703 aa  278  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  30.83 
 
 		 668 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  28.82 
 
 		 986 aa  273  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.27 
 
 		 692 aa  272  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  29.94 
 
 		 644 aa  270  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  30 
 
 		 694 aa  269  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.42 
 
 		 690 aa  268  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.81 
 
 		 690 aa  267  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  30.19 
 
 		 685 aa  267  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.81 
 
 		 690 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.81 
 
 		 690 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.81 
 
 		 690 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.36 
 
 		 721 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.2 
 
 		 692 aa  266  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.67 
 
 		 714 aa  265  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.26 
 
 		 714 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.78 
 
 		 714 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.73 
 
 		 714 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.03 
 
 		 741 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>