More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0078 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  735    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  82.91 
 
 		 357 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  80.9 
 
 		 357 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  77.05 
 
 		 358 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  81.23 
 
 		 357 aa  577  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  73.39 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  70.54 
 
 		 357 aa  512  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  47.59 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 359 aa  371  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  50.85 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  52.39 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 372 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 359 aa  361  9e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 357 aa  360  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 355 aa  360  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 370 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  51.13 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 358 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 356 aa  358  5e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 		 362 aa  357  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 		 362 aa  357  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  48.02 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 362 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 366 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  55.17 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  55.17 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  48.13 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  54.23 
 
 		 351 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 362 aa  352  8e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 352 aa  351  8.999999999999999e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1020  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.16 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1210  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 354 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>