69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4975 on replicon NC_008762
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  810    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  53.8 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  48.41 
 
 		 369 aa  326  5e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  42.82 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  40.24 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  37.46 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  34.76 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  27.48 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  29.02 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  26.79 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  33.78 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  31.15 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  31.15 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  27.83 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  32.32 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  28.74 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  29.15 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  29.38 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  29.38 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  28.57 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  25.76 
 
 		 377 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  29.13 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  28.24 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 617 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  26.79 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  30.77 
 
 		 539 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  29.26 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  27.73 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  26.2 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  27.15 
 
 		 638 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  25.71 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  26.8 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  29.59 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  30.43 
 
 		 650 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  30.05 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  25.57 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  25.71 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  33.77 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  23.91 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  25.86 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  25.73 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  33.06 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  23.02 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  25.88 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  29.26 
 
 		 458 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  28.32 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  28.85 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  32.91 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  25.5 
 
 		 194 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  25.52 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  25.27 
 
 		 589 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  24.9 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  24.47 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  23.53 
 
 		 330 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  24.66 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  27.46 
 
 		 130 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  23.11 
 
 		 360 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  22.28 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  23.66 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  23.49 
 
 		 392 aa  46.2  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  30.65 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  30.63 
 
 		 159 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  28.47 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  21.57 
 
 		 221 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  21.57 
 
 		 221 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  25.23 
 
 		 499 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  24.1 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  34.92 
 
 		 593 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  21.65 
 
 		 178 aa  43.1  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>