More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2652 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 410 aa  825    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  39.35 
 
 		 961 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.29 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40.51 
 
 		 684 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.15 
 
 		 489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.62 
 
 		 789 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.54 
 
 		 528 aa  126  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1402 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.07 
 
 		 557 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.54 
 
 		 831 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  43.33 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  42.25 
 
 		 254 aa  120  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1002 aa  119  9e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.27 
 
 		 235 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.29 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.49 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.38 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.69 
 
 		 245 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.62 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  38.5 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.51 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.51 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.64 
 
 		 2413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.58 
 
 		 341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.49 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1037 aa  111  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.47 
 
 		 685 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1877 aa  110  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 		 1430 aa  110  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.83 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  37.43 
 
 		 490 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.43 
 
 		 490 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 271 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.85 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.3 
 
 		 278 aa  107  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  35.75 
 
 		 509 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.02 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  35.75 
 
 		 509 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.54 
 
 		 185 aa  106  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.81 
 
 		 1012 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  35.75 
 
 		 509 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  40 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.67 
 
 		 222 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  33.18 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 1032 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  38.15 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.71 
 
 		 838 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.97 
 
 		 255 aa  103  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 193 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  40.27 
 
 		 731 aa  102  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.5 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.1 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  33.15 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.81 
 
 		 264 aa  101  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.26 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.07 
 
 		 255 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  36.31 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 1261 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.31 
 
 		 325 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  36.31 
 
 		 325 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  39.44 
 
 		 208 aa  96.3  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  37.13 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  33.13 
 
 		 978 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  36.53 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  40.38 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  35.19 
 
 		 464 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  37.24 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  38.82 
 
 		 331 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  36.53 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  36.84 
 
 		 172 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  38.82 
 
 		 331 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.53 
 
 		 321 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  34.3 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  30.34 
 
 		 331 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.99 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.17 
 
 		 272 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  30.99 
 
 		 246 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.19 
 
 		 293 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  35.53 
 
 		 236 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.97 
 
 		 523 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.57 
 
 		 890 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1059 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  36.62 
 
 		 680 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.13 
 
 		 1110 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.36 
 
 		 679 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  34.9 
 
 		 328 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  36.42 
 
 		 817 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  35.93 
 
 		 285 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  31.93 
 
 		 1086 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  35.12 
 
 		 327 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.59 
 
 		 552 aa  91.3  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1160 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  42.52 
 
 		 181 aa  90.9  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0178  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.34 
 
 		 679 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>