141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3132 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3132  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3761  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.63 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.54 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  28.46 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  28.31 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  28.15 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0921  biopolymer transport protein, ExbD  28.37 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.24 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  29.08 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.03 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.48 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  27.22 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0325  TonB system transport protein ExbD1  26.81 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000982985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  29.01 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6005  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.86 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1132  TonB system transport protein ExbD  24.63 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  27.13 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.74 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.08 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  24.22 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  26.52 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  26.92 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  26.15 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  26.15 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  24.31 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.6 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.21 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.21 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0748  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.18 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.9 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.99 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.54 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  25.53 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.5 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.37 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.21 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.43 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3966  TonB system transport protein ExbD  26.09 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  26.98 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.66 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  23.6 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  27.21 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  27.74 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  28.47 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  25.58 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.48 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  27.74 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  27.74 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  27.74 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  25.58 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  24.65 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05242  biopolymer transport protein  28.78 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  22.52 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1268  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.4 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0930334  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2306  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.4 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426715  normal  0.290697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3332  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.59 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156003  normal  0.605878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0726  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.37 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  25.58 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3071  hypothetical protein  26.32 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.19 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  27.07 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.28 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.81 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.94 
 
 		 142 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.43 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.01 
 
 		 145 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2860  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.7 
 
 		 226 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070189  hitchhiker  0.000343254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3261  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.7 
 
 		 226 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  27.74 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  28.46 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  27.74 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  27.74 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  22.48 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.47 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.58 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.35 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1516  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.03 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.890263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  25.78 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  25.78 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  27.91 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.88 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>