19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3071 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3071  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0444  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  76.51 
 
 		 165 aa  244  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3561  sigma-70 factor  32.93 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.373178  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1808  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.48 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.712122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0537  sigma-70 factor  38.1 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1224  sigma-70 factor  33.72 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1230  adventurous gliding motility protein S  28.05 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.096115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1596  biopolymer transport protein  29.38 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2955  hypothetical protein  29.41 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4308  adventurous gliding motility protein S  26.09 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4444  adventurous gliding motility protein S  25.77 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4463  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.77 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.272834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4453  adventurous gliding motility protein S  24.85 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3761  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.81 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3390  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.12 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.170146  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3132  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.17 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.54 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  22.78 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>