24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0444 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0444  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 165 aa  336  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3071  hypothetical protein  76.51 
 
 		 166 aa  265  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1808  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.64 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.712122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0537  sigma-70 factor  32.93 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3561  sigma-70 factor  29.34 
 
 		 178 aa  88.2  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.373178  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1224  sigma-70 factor  32.95 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1230  adventurous gliding motility protein S  29.7 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.096115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1596  biopolymer transport protein  29.88 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4308  adventurous gliding motility protein S  29.52 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4444  adventurous gliding motility protein S  27.65 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4463  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.65 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.272834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4453  adventurous gliding motility protein S  27.71 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2955  hypothetical protein  27.78 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3132  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.67 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3390  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.71 
 
 		 187 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.170146  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1807  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.32 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0912  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.29 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0769  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.29 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3761  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.35 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.21 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.3 
 
 		 140 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.32 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.85 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.97 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>