21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0537 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0537  sigma-70 factor  100 
 
 		 170 aa  340  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3561  sigma-70 factor  46.47 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.373178  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1230  adventurous gliding motility protein S  47.27 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.096115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1808  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.98 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.712122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1224  sigma-70 factor  42.05 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1596  biopolymer transport protein  42.59 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3071  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2955  hypothetical protein  34.64 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0444  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.71 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4453  adventurous gliding motility protein S  29.79 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4308  adventurous gliding motility protein S  27.38 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4463  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.38 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.272834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4444  adventurous gliding motility protein S  27.54 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3390  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.44 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.170146  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.67 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.32 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.38 
 
 		 132 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  24.1 
 
 		 153 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  20.38 
 
 		 132 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  24.1 
 
 		 153 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  25.62 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>