25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1230 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1230  adventurous gliding motility protein S  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.096115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0537  sigma-70 factor  47.27 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3561  sigma-70 factor  41.61 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.373178  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1808  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.24 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.712122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1224  sigma-70 factor  38.36 
 
 		 177 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1596  biopolymer transport protein  41.51 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2955  hypothetical protein  29.87 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3071  hypothetical protein  28.05 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4444  adventurous gliding motility protein S  32.21 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4308  adventurous gliding motility protein S  32.17 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4453  adventurous gliding motility protein S  30.46 
 
 		 194 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4463  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.54 
 
 		 194 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.272834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0444  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.7 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.56 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0119  biopolymer transport-like protein  30.61 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0532523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.07 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.07 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3390  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.170146  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.71 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.08 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  25.16 
 
 		 157 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  26.09 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.9 
 
 		 155 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.67 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>