More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2069 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04124  valyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 951 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3739  valyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 951 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 880 aa  707    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1716  valyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 963 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.894816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0977  valyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 948 aa  718    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0923  valyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 959 aa  685    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 909 aa  653    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 876 aa  664    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 921 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2236  valyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 968 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 918 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0738  valyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 973 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0948  valyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 910 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 958 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1268  valyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 948 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1691  valyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 955 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 884 aa  666    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 918 aa  699    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2085  valyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 953 aa  679    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000735472  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0927  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 955 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 921 aa  692    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 921 aa  691    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 904 aa  670    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 948 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 984 aa  664    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 943 aa  698    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 933 aa  703    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0863  valyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 955 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 912 aa  663    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 952 aa  643    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 1002 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1846  valyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 955 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 929 aa  715    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 948 aa  722    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3112  valyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 958 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4585  valyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 955 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 901 aa  642    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 925 aa  744    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 1006 aa  698    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 914 aa  751    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33832  predicted protein  37.52 
 
 		 1056 aa  649    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 917 aa  717    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 924 aa  701    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0741  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 955 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 918 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 909 aa  768    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 926 aa  684    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 879 aa  679    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 880 aa  733    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2633  valyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 955 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 947 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2376  valyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 990 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 922 aa  703    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1460  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 955 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 943 aa  699    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3721  valyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 973 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0971795  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1335  valyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 959 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 968 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1015  valyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 948 aa  720    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 947 aa  725    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 954 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 984 aa  672    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2630  valyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 955 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00324916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 865 aa  739    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 929 aa  646    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3650  valyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 951 aa  674    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.227036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0959  valyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 955 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2742  valyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 958 aa  691    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.829752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2896  valyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 976 aa  695    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.588712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 921 aa  695    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 926 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1669  valyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 955 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 880 aa  711    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 880 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 		 948 aa  676    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 911 aa  723    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 958 aa  684    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 958 aa  688    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 917 aa  734    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 968 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1137  putative valyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 941 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.835272  normal  0.0253174 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 933 aa  701    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1321  valyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 955 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 950 aa  714    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 902 aa  665    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 879 aa  663    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 894 aa  688    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1441  valyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 955 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0422  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 955 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 929 aa  710    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 958 aa  687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 876 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 943 aa  735    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2178  valyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 976 aa  657    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 953 aa  696    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 880 aa  705    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0393  valyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 952 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 897 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0959  valyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 950 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3169  valyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 979 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>