More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0768 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  46.8 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  39.75 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  40 
 
 		 243 aa  208  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  40 
 
 		 243 aa  207  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  48.26 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  39.67 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  44.29 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  39.83 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  40.5 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  42.74 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  38.59 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  43.86 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  41.1 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  37.24 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  41.44 
 
 		 340 aa  175  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  42.11 
 
 		 337 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  38.77 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  36.99 
 
 		 338 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  36.59 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  40.91 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  40.09 
 
 		 339 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  40.09 
 
 		 339 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  40.45 
 
 		 337 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  36.51 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  37.76 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  36.1 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  37.34 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  39.11 
 
 		 339 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  35.75 
 
 		 338 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  38.75 
 
 		 303 aa  166  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  34.84 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  36.51 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  36.1 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  35.75 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  36.89 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  37.34 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  36.51 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  37.34 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  37.34 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  36.51 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  41.01 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  37.34 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 		 541 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  36.51 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  35.25 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  37.5 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  37.5 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.08 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  36.51 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  37.5 
 
 		 337 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  38.5 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  37.13 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.34 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.53 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  37.34 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  38.91 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  36.07 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  38.22 
 
 		 332 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  37.04 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 583 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  38.66 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40 
 
 		 510 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  39.32 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.16 
 
 		 327 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.25 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  36.75 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  39.65 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.4 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  38.74 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.23 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.99 
 
 		 330 aa  158  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 1171 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  35.53 
 
 		 298 aa  158  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  38.5 
 
 		 338 aa  158  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  39.09 
 
 		 512 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  35.2 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  37.12 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.67 
 
 		 328 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 		 324 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.81 
 
 		 327 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.86 
 
 		 319 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  41.06 
 
 		 340 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  36.61 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>