More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2917 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 561 aa  1092    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  58.3 
 
 		 566 aa  588  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  57.3 
 
 		 562 aa  588  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  57.81 
 
 		 561 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  59.17 
 
 		 575 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  57.33 
 
 		 572 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  55.45 
 
 		 558 aa  545  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  52.69 
 
 		 541 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  54 
 
 		 572 aa  525  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  52.74 
 
 		 551 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  49.81 
 
 		 595 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  51.64 
 
 		 546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  45.8 
 
 		 548 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  45.07 
 
 		 547 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  62.73 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  44.89 
 
 		 547 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  45.75 
 
 		 720 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  38.46 
 
 		 566 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  46.12 
 
 		 566 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  38.27 
 
 		 566 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  38.09 
 
 		 565 aa  365  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  36.96 
 
 		 566 aa  348  2e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.11 
 
 		 575 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 		 592 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 		 574 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 574 aa  213  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  30.04 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 571 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 		 581 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 578 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 		 674 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 741 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 775 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 656 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 577 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  27.31 
 
 		 650 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.9 
 
 		 567 aa  160  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 		 567 aa  160  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  26.81 
 
 		 648 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 567 aa  158  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 671 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.52 
 
 		 673 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  28.44 
 
 		 556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.53 
 
 		 579 aa  157  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  27.7 
 
 		 561 aa  156  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  26.93 
 
 		 648 aa  156  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.43 
 
 		 671 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  26.49 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  28.68 
 
 		 561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  26.27 
 
 		 648 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  26.27 
 
 		 648 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 771 aa  153  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 		 636 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 664 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 649 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  26.63 
 
 		 682 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 674 aa  151  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.17 
 
 		 663 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  25.77 
 
 		 662 aa  150  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  27.82 
 
 		 575 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.22 
 
 		 528 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  26.45 
 
 		 648 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  30 
 
 		 574 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 		 666 aa  150  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.45 
 
 		 648 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 		 653 aa  150  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  27.64 
 
 		 529 aa  149  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  26.54 
 
 		 648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  26.45 
 
 		 648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.11 
 
 		 649 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  26.37 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 		 664 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.27 
 
 		 553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 583 aa  148  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 		 666 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 		 598 aa  147  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 668 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  26.64 
 
 		 648 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 		 656 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.41 
 
 		 659 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  29.28 
 
 		 584 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 		 581 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 584 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  26.18 
 
 		 558 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.5 
 
 		 524 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 666 aa  144  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  26.86 
 
 		 654 aa  144  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  27.07 
 
 		 562 aa  143  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  29.96 
 
 		 678 aa  143  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  29.27 
 
 		 666 aa  143  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  27 
 
 		 584 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 		 667 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  26.04 
 
 		 649 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  25.52 
 
 		 561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>