More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2548 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  100 
 
 		 391 aa  761    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  63.57 
 
 		 394 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  52.49 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  52.23 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  58.8 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  40.81 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  39.48 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  37.11 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  36.63 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  37.34 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  39.57 
 
 		 416 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  37.02 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  36.15 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  34.7 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  36.63 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  37.94 
 
 		 397 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  37.94 
 
 		 397 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  37.94 
 
 		 397 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  37 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  37.84 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  37.44 
 
 		 465 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  36.27 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  36.01 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  35.9 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  35.64 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  34.2 
 
 		 379 aa  185  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  35.68 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  38.62 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  35.63 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  34.91 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  34.91 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  34.54 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  35.51 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  37.5 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  35.66 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  34.65 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 385 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  37.05 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  35.15 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  33.43 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  33.51 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  35.01 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  33.16 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  32.9 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  32.83 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  31.18 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  31.93 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  33.33 
 
 		 374 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  32.96 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  38.87 
 
 		 238 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  36.41 
 
 		 323 aa  116  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  43.54 
 
 		 194 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  36.96 
 
 		 180 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  36.11 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 		 199 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  34.2 
 
 		 301 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  38.51 
 
 		 185 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  33.96 
 
 		 199 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  28.44 
 
 		 324 aa  93.2  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  42.03 
 
 		 182 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  40.69 
 
 		 178 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  37.65 
 
 		 175 aa  90.9  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  36.94 
 
 		 190 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  39.42 
 
 		 182 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  39.42 
 
 		 182 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  39.42 
 
 		 182 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  39.42 
 
 		 182 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  39.42 
 
 		 182 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  45.71 
 
 		 182 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  45.71 
 
 		 182 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  45.71 
 
 		 182 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  36.93 
 
 		 207 aa  87.4  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  36 
 
 		 183 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  33.65 
 
 		 284 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  34.13 
 
 		 181 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  37.04 
 
 		 159 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  32.05 
 
 		 184 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  37.04 
 
 		 159 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  44.53 
 
 		 178 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  38.01 
 
 		 178 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  44 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  34.83 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  34.36 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>