More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2228 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  100 
 
 		 289 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  65.73 
 
 		 289 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  65.73 
 
 		 289 aa  341  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  64.44 
 
 		 291 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  62.24 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  59.03 
 
 		 290 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  63.51 
 
 		 290 aa  325  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  57.99 
 
 		 290 aa  324  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  56.94 
 
 		 290 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  61.62 
 
 		 291 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  64.69 
 
 		 290 aa  318  9e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  63.41 
 
 		 290 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  57.64 
 
 		 291 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  63.54 
 
 		 290 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  63.03 
 
 		 290 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  57.64 
 
 		 289 aa  309  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  60.28 
 
 		 290 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  57.29 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  58.06 
 
 		 296 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  62.11 
 
 		 295 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  62.46 
 
 		 295 aa  301  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  62.11 
 
 		 295 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  56.6 
 
 		 290 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  61.17 
 
 		 300 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  57.65 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  55.79 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  55.4 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  55.32 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  58.33 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  59.27 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  52.69 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  55.23 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  58.3 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  52.22 
 
 		 299 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  51.58 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  59.09 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  52.96 
 
 		 287 aa  261  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  49.12 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  53.55 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  51.62 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  47.14 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  55.71 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.12 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.12 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 		 278 aa  142  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  36.27 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  31.51 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  32.26 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.58 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.71 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.02 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.02 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.02 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.02 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  34.2 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  31.54 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.7 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.44 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.44 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  29.82 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  25.8 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  25.8 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  25.8 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  29.82 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  30.32 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.31 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  32.36 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  30.52 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  30.52 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  29.08 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  31.91 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.29 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.36 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  28.74 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  27.68 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  29.48 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  31.87 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  31.44 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  31.1 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.18 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  32.81 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  33.72 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  27.52 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.18 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.18 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.18 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  28.46 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  27.92 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.18 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  29.66 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.12 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.54 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  29.89 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  29.75 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>