More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1122 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  100 
 
 		 285 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  73.84 
 
 		 284 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  72.54 
 
 		 284 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  72.18 
 
 		 284 aa  387  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  73.68 
 
 		 286 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  60.87 
 
 		 284 aa  308  6.999999999999999e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  58.06 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  63.73 
 
 		 287 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  59.14 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  63.9 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  63.18 
 
 		 289 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  55.91 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  62.23 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  57.91 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  62.24 
 
 		 295 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  59.7 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  58.91 
 
 		 294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  61.05 
 
 		 295 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  61.05 
 
 		 295 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  57.35 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  60.49 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  58.52 
 
 		 291 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  55.71 
 
 		 299 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  60 
 
 		 290 aa  275  8e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  56.12 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  59.09 
 
 		 290 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  55.4 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  57.2 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  58.36 
 
 		 290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  57.5 
 
 		 291 aa  271  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  59.27 
 
 		 289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  56.69 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  63.12 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  52.71 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  58.48 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  58.36 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  54.15 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  57.46 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  47.33 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  50 
 
 		 288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  54.71 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  55.87 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.33 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  34.8 
 
 		 280 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.69 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.32 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.71 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.71 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  34.4 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.89 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  36.07 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  36.07 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.48 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.79 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.54 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.32 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.32 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  34.47 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.99 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.22 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  31.79 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  34.78 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  32.27 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  35.79 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  33.1 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  31.05 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.2 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  31.72 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.83 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  34.09 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.2 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.2 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.2 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  33.7 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30.47 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  31.21 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  31.06 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  31.27 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  31.06 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  31.21 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  28.19 
 
 		 301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  30.34 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  32.48 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.94 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.94 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.94 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  28.62 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  30.88 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  30.66 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  29.43 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.55 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  32.7 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>