More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0221 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  61.87 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  62.9 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  59.78 
 
 		 290 aa  298  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  60.76 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  62.41 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  57.97 
 
 		 290 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  56.88 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  62.06 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  62.96 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  57.97 
 
 		 289 aa  292  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  59.86 
 
 		 288 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  57.76 
 
 		 289 aa  291  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  62.22 
 
 		 289 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  57.25 
 
 		 290 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  58.78 
 
 		 296 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  57.24 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  58.48 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  58.12 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  58.45 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  56.88 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  57.19 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  55.44 
 
 		 294 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  59.01 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  60.64 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  62.5 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  60.52 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  53.98 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  60.77 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  59.01 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  51.81 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  56.99 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  59.32 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  57.61 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  56.27 
 
 		 285 aa  258  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  60.98 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  56.04 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  48.41 
 
 		 290 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  53.82 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  54.51 
 
 		 287 aa  232  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  48.56 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  59.5 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  37.97 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.73 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.73 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.16 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.72 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.64 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  30.56 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.64 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.87 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.21 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  30 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  33.79 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.63 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  30.21 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  30.21 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  30.21 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.89 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31.79 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  31.99 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.68 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29.49 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  32.77 
 
 		 441 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  31.72 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.18 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 280 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.05 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  29.43 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  35.38 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.4 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  32.12 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  34.93 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  31.43 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  30.88 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  31.7 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  32.53 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  29.53 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  33.56 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  34.18 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.64 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.64 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.64 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.64 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.64 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  32.07 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>