More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0351 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
290 aa  552  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  53.74 
 
 
288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  53.87 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  51.62 
 
 
290 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  50 
 
 
291 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  50 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  51.08 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  50.71 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  48.28 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  52.42 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  51.26 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  49.29 
 
 
289 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  46.69 
 
 
299 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  47.52 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  49.82 
 
 
290 aa  251  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  49.47 
 
 
288 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  49.45 
 
 
286 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  46.45 
 
 
290 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  48.23 
 
 
289 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  48.94 
 
 
289 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  46.81 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  50.79 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  47.43 
 
 
291 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  49.12 
 
 
289 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  44.88 
 
 
294 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  48.74 
 
 
284 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  47.65 
 
 
284 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  48.04 
 
 
290 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  48.16 
 
 
284 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  48.03 
 
 
290 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  49.25 
 
 
293 aa  235  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  48.41 
 
 
290 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  48.94 
 
 
290 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  49.47 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  47.33 
 
 
285 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  48.23 
 
 
288 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  48.69 
 
 
288 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  45.58 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  45.19 
 
 
288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  46.1 
 
 
304 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 
284 aa  199  5e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  51.1 
 
 
295 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
277 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.53 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  35.54 
 
 
289 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.84 
 
 
288 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  34.33 
 
 
288 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 
278 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.84 
 
 
288 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.84 
 
 
288 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  34.98 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.57 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  34.98 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.3 
 
 
312 aa  142  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  31.12 
 
 
304 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.87 
 
 
300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  32.96 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.58 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  32.1 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  32.1 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  32.1 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.97 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.84 
 
 
287 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  32.21 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  31.79 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  30.86 
 
 
272 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  30.86 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  30.34 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  31.78 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  30.5 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  32.87 
 
 
290 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  32.87 
 
 
290 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  30.32 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  32.03 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
267 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  32.61 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  29.66 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32.71 
 
 
276 aa  116  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.9 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.9 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  30.4 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  30.22 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.93 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  30.22 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  30.15 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  30.94 
 
 
280 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30.74 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  29.82 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  28.02 
 
 
285 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  28.21 
 
 
285 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.55 
 
 
282 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  32.55 
 
 
268 aa  109  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  29.82 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  29.84 
 
 
303 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  31.79 
 
 
312 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  29.15 
 
 
291 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.55 
 
 
282 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>