More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2634 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 289 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  96.89 
 
 		 289 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  77.16 
 
 		 290 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  74.31 
 
 		 290 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  71.88 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  69.79 
 
 		 290 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  71.53 
 
 		 290 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  60.07 
 
 		 290 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  65.14 
 
 		 291 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  65.73 
 
 		 289 aa  332  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  58.68 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  62.02 
 
 		 289 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  60.42 
 
 		 290 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  62.72 
 
 		 291 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  60.28 
 
 		 289 aa  323  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  59.79 
 
 		 286 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  59.03 
 
 		 290 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  59.23 
 
 		 291 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  58.33 
 
 		 290 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  62.96 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  62.85 
 
 		 295 aa  308  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  60.28 
 
 		 284 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  60.29 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  61.89 
 
 		 295 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  63.36 
 
 		 290 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  60.29 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  61.89 
 
 		 295 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  55.36 
 
 		 299 aa  298  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  63.9 
 
 		 285 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  54.58 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  56.29 
 
 		 296 aa  288  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  57.5 
 
 		 288 aa  288  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  54.8 
 
 		 293 aa  285  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  56.69 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  61.45 
 
 		 288 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  59.51 
 
 		 288 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  55.59 
 
 		 287 aa  265  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  58.8 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  48.23 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  51.96 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  50.54 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  59.49 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.89 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.62 
 
 		 279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.77 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  31.34 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  31.34 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  35.61 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.34 
 
 		 288 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 288 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.6 
 
 		 280 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.23 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.23 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.22 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.5 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29.64 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  33.86 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  31.47 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.46 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  31.47 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30.97 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  31.58 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  31.94 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  32.28 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.05 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.37 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.97 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  31.56 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  28.92 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.18 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  30.97 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  28 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  32.95 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.97 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  32.38 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.48 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.48 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  31.37 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  30.25 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  31.76 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  32.46 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  32.14 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  29.64 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  29.85 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  31.9 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  30.15 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  29.5 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  31.73 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  28.83 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>