More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1973 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  100 
 
 		 293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  58.27 
 
 		 289 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  57.65 
 
 		 290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  55.52 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  57.19 
 
 		 289 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  55.52 
 
 		 290 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  55.16 
 
 		 290 aa  304  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  53.36 
 
 		 290 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  55.04 
 
 		 291 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  55.23 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  56.39 
 
 		 296 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  60.63 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  54.9 
 
 		 288 aa  288  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  55.83 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  55.48 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  54.8 
 
 		 289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  56.99 
 
 		 290 aa  282  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  52.65 
 
 		 284 aa  282  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  52.65 
 
 		 286 aa  282  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  55.12 
 
 		 295 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  59.18 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  54.09 
 
 		 289 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  51.6 
 
 		 291 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  53.02 
 
 		 284 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  52.77 
 
 		 300 aa  275  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  51.94 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  52.69 
 
 		 289 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  56.52 
 
 		 290 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  56.41 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  55.27 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  57.14 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  50 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  55.64 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  57.09 
 
 		 290 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  51.71 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  54.15 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  48.94 
 
 		 288 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  52.55 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  50.36 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  49.25 
 
 		 290 aa  231  8.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  47.08 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  48.07 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 278 aa  155  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 278 aa  155  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.18 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  32.62 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  30.91 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.74 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.37 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  30.69 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.37 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.37 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.97 
 
 		 280 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.07 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.14 
 
 		 281 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.1 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.1 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  28.94 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.42 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  25.81 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  29.63 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  30.04 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  30.38 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  30.65 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  28.47 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  30.48 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  28.78 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  29.89 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  28.17 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  29.45 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  31.42 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.34 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  25.27 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  26.44 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  27.27 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  26.44 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  27.59 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  26.44 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  26.62 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  30.17 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  27.46 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  29.2 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  29 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  28.47 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  26.44 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  29.18 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  29.18 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  27.82 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.74 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  27.65 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  25.35 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  31.27 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  26.34 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  25.61 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>