More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0654 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  100 
 
 		 284 aa  541  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  85.56 
 
 		 286 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  82.39 
 
 		 284 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  82.04 
 
 		 284 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  73.84 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  63.64 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  55.71 
 
 		 290 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  56.23 
 
 		 290 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  54.8 
 
 		 290 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  58.18 
 
 		 289 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  61.15 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  58.12 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  55.52 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  57.35 
 
 		 291 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  60.43 
 
 		 290 aa  281  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  60.43 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  59.57 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  58.48 
 
 		 289 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  58.7 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  56.78 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  55.27 
 
 		 289 aa  275  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  56.62 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  55.44 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  57.84 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  57.8 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  54.01 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  52.65 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  62.36 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  57.24 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  52.5 
 
 		 290 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  56.94 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  56.04 
 
 		 288 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  59.23 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  57.3 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  56.93 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  56.83 
 
 		 288 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  55.23 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  55.87 
 
 		 288 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  50.18 
 
 		 288 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  48.16 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  54.51 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  56.43 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.16 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  36.5 
 
 		 312 aa  158  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.97 
 
 		 278 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.97 
 
 		 278 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.7 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.27 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.73 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  37.41 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  33.2 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.45 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  33.2 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.75 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  36.74 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  34.84 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  32.38 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  35.63 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  33.33 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  34.28 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.84 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  30.96 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  30.66 
 
 		 415 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  33.33 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.75 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.75 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  32.64 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  33.45 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  31.7 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.1 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  32.16 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.99 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.01 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  31.7 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  29.78 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  29.78 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  29.78 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  36.17 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.52 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.52 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  31.8 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.52 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.52 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.52 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  33.69 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.28 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  29.79 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.21 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  29.79 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  33.58 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  32.65 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>