More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3391 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  100 
 
 		 304 aa  578  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  56.79 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  54.68 
 
 		 290 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  56.73 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  55.04 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  56.47 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  57.45 
 
 		 289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  58.09 
 
 		 290 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  61.65 
 
 		 288 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  60.49 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  58.21 
 
 		 291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  58.12 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  56.73 
 
 		 289 aa  276  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  55.87 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  58.52 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  58.8 
 
 		 289 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  58.01 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  58.01 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  57.65 
 
 		 295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  57.45 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  56.32 
 
 		 290 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  55.56 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  57.24 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  52.16 
 
 		 299 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  54.74 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  53.79 
 
 		 284 aa  258  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  57.66 
 
 		 290 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  51.77 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  54.51 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  50.36 
 
 		 293 aa  254  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  57.71 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  53.17 
 
 		 289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  51.57 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  52.65 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  55.56 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  57.85 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  52.11 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  54.71 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  46.1 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  51.82 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  51.05 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.77 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.82 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.94 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.79 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.32 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.17 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.58 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.58 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  33.22 
 
 		 441 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  33.22 
 
 		 441 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  28.62 
 
 		 368 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  35.14 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29.75 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.65 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  29.79 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  27.4 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  31.85 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  26.76 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  29.63 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  30.11 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  27.64 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  33.6 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.21 
 
 		 280 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  30.2 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  28.15 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  28.32 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  28.93 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  31.03 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  29.45 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  27.78 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.53 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  26.95 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  26.95 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  26.95 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  32.13 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  28.21 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  27.78 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  28.47 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.11 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  28.37 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  28.21 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  34.58 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  32.28 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  28.77 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  28.77 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0299  ABC-3 protein  34.15 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0103187  normal  0.0511168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.97 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>