More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0105 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 
284 aa  554  1e-157  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  59.57 
 
 
286 aa  308  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  60.87 
 
 
285 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  58.12 
 
 
284 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  56.12 
 
 
284 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  56.68 
 
 
284 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  57.8 
 
 
287 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  53.28 
 
 
290 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  50.54 
 
 
289 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  50.54 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  50.18 
 
 
290 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  50.18 
 
 
290 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  48.72 
 
 
290 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  51.8 
 
 
290 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  47.14 
 
 
294 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  46.1 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  48.56 
 
 
300 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  43.77 
 
 
289 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  48.95 
 
 
288 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  46.55 
 
 
288 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  48.12 
 
 
296 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  44.53 
 
 
299 aa  228  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  53.7 
 
 
290 aa  228  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  44.09 
 
 
290 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  46.74 
 
 
291 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  47.14 
 
 
289 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  44.44 
 
 
290 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  48.01 
 
 
295 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  47.31 
 
 
295 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  44.13 
 
 
289 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  48.01 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  47.1 
 
 
290 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  47.08 
 
 
293 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  45.04 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  43.43 
 
 
290 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  44.13 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  45.19 
 
 
288 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  44.06 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  46.84 
 
 
304 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  40 
 
 
288 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  45.56 
 
 
295 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.54 
 
 
281 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.02 
 
 
280 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.94 
 
 
280 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  32.72 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.35 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.57 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.2 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.2 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.95 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.95 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.82 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.26 
 
 
278 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.26 
 
 
278 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.47 
 
 
285 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.11 
 
 
290 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.11 
 
 
290 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  29.68 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  30.4 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30 
 
 
289 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  28.78 
 
 
285 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  30.5 
 
 
306 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  29.62 
 
 
304 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29.67 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  29.86 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  30.47 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  29.75 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  30.31 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  31.32 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.09 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  28.89 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  29.75 
 
 
279 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  30.14 
 
 
291 aa  109  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  30.36 
 
 
281 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  31.77 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  27.96 
 
 
285 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  29.75 
 
 
286 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  29.72 
 
 
297 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.2 
 
 
285 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  30.5 
 
 
296 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  30.43 
 
 
281 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  28.32 
 
 
285 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.15 
 
 
297 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  31.18 
 
 
312 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.15 
 
 
297 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.15 
 
 
297 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  31.87 
 
 
280 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  28.62 
 
 
278 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  28.62 
 
 
294 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  30.2 
 
 
283 aa  105  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  29.04 
 
 
279 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  31.29 
 
 
289 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  28.95 
 
 
283 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  30.07 
 
 
294 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  30.07 
 
 
294 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  30.07 
 
 
294 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>