More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1562 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  100 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  43.42 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  35.02 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  35.02 
 
 		 287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  36.43 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  41.04 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  42.29 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  38.91 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4200  aminotransferase class IV  45.2 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  41.01 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  38.78 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  31.91 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.57 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.85 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.3 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  41.41 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  35.66 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  41.41 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.02 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  31.21 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  30.85 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  31.21 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  30.85 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.49 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  30.85 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  30.85 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  31.21 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  30.85 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  31.21 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  41.25 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  37.78 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.06 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  32.29 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  32.58 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  32.27 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  35.93 
 
 		 300 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  37.4 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  32.27 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  35.5 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  33.58 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  32.12 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  35.36 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  32.52 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.44 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  35.34 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.41 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.41 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.44 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  32.06 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  32.38 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.05 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.05 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  33.69 
 
 		 292 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.74 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  34.15 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  34.15 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  33.68 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  32.04 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  33.81 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  33.68 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  38.98 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  32.03 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  32.06 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  33.97 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  41.02 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.42 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  35.43 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  34.42 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.32 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  33.45 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  32.95 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  34.74 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  32.5 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.36 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.69 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.94 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  31.23 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  33.83 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  33.69 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2852  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.93 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.46 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  28.78 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>