More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1994 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1056  formate dehydrogenase  84.39 
 
 		 1168 aa  2108    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0396  formate dehydrogenase alpha subunit  70.38 
 
 		 1175 aa  1743    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0603241 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0954  molybdopterin oxidoreductase  75.17 
 
 		 1168 aa  1871    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.859689  normal  0.0860777 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1408  formate dehydrogenase  71.48 
 
 		 1170 aa  1779    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1994  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 1168 aa  2394    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00248434  normal  0.623022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.64 
 
 		 1059 aa  280  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.61 
 
 		 879 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.29 
 
 		 1010 aa  273  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.84 
 
 		 1061 aa  267  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.87 
 
 		 1009 aa  262  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.62 
 
 		 685 aa  262  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  28.4 
 
 		 1010 aa  258  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  27.55 
 
 		 1010 aa  255  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.49 
 
 		 893 aa  249  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.61 
 
 		 1016 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.56 
 
 		 963 aa  241  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  38.07 
 
 		 999 aa  239  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  30.88 
 
 		 953 aa  239  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  31.48 
 
 		 980 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.01 
 
 		 900 aa  237  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.59 
 
 		 1012 aa  235  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  30.41 
 
 		 980 aa  234  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  30.98 
 
 		 980 aa  234  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  29.06 
 
 		 713 aa  234  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.52 
 
 		 1050 aa  234  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.36 
 
 		 1014 aa  234  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  29.04 
 
 		 949 aa  233  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.52 
 
 		 1013 aa  233  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.77 
 
 		 987 aa  232  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.76 
 
 		 1421 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.78 
 
 		 979 aa  232  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  31.64 
 
 		 996 aa  232  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.99 
 
 		 979 aa  231  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.99 
 
 		 979 aa  231  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 		 950 aa  231  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 		 950 aa  231  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  30.88 
 
 		 964 aa  231  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.28 
 
 		 927 aa  231  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  29.58 
 
 		 745 aa  231  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 		 950 aa  230  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 		 950 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  29.25 
 
 		 951 aa  230  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  30.03 
 
 		 979 aa  230  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  30.24 
 
 		 989 aa  229  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.22 
 
 		 1005 aa  229  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.78 
 
 		 979 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.33 
 
 		 687 aa  229  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  38.28 
 
 		 1001 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.78 
 
 		 979 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.78 
 
 		 1012 aa  229  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.59 
 
 		 1425 aa  229  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  38.82 
 
 		 1025 aa  229  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 		 949 aa  229  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.21 
 
 		 949 aa  228  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.65 
 
 		 949 aa  228  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.64 
 
 		 987 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  27.06 
 
 		 1014 aa  228  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  38.04 
 
 		 1001 aa  228  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  26.03 
 
 		 1026 aa  228  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.33 
 
 		 904 aa  228  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  29.61 
 
 		 989 aa  227  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  28.57 
 
 		 951 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  35.87 
 
 		 970 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.46 
 
 		 989 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  30.47 
 
 		 987 aa  226  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  30.34 
 
 		 950 aa  226  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  30.05 
 
 		 950 aa  226  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.22 
 
 		 950 aa  226  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  38.82 
 
 		 1012 aa  226  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.5 
 
 		 893 aa  226  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.72 
 
 		 979 aa  225  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.12 
 
 		 1012 aa  226  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  29.87 
 
 		 950 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.34 
 
 		 979 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.63 
 
 		 1008 aa  224  7e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  30.36 
 
 		 980 aa  224  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  29.92 
 
 		 687 aa  224  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.93 
 
 		 1004 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.93 
 
 		 1004 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  28.42 
 
 		 951 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  28.91 
 
 		 932 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.97 
 
 		 662 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  28.96 
 
 		 951 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  29.2 
 
 		 950 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  29.2 
 
 		 950 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  29.2 
 
 		 950 aa  221  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.83 
 
 		 1005 aa  221  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.37 
 
 		 1016 aa  221  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.18 
 
 		 723 aa  221  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  26.54 
 
 		 1016 aa  220  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.2 
 
 		 1016 aa  220  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  26.54 
 
 		 1016 aa  220  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.55 
 
 		 754 aa  220  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  26.54 
 
 		 1016 aa  220  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.54 
 
 		 1012 aa  220  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  29.38 
 
 		 951 aa  220  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  29.19 
 
 		 949 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.64 
 
 		 688 aa  219  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.31 
 
 		 1011 aa  219  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  26.54 
 
 		 1016 aa  219  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>