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for query gene Phep_3683 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 567 aa  1176    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.28 
 
 		 570 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.52 
 
 		 584 aa  598  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  50.35 
 
 		 574 aa  593  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.53 
 
 		 568 aa  588  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  50 
 
 		 566 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.26 
 
 		 568 aa  554  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  50.44 
 
 		 568 aa  551  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.48 
 
 		 584 aa  538  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.19 
 
 		 564 aa  532  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.35 
 
 		 587 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.62 
 
 		 571 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.07 
 
 		 570 aa  438  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.3 
 
 		 574 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.07 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  37.19 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.19 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.1 
 
 		 885 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.68 
 
 		 907 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.28 
 
 		 573 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  37.76 
 
 		 568 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.38 
 
 		 831 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.67 
 
 		 827 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  35.95 
 
 		 578 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.96 
 
 		 574 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.28 
 
 		 578 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.83 
 
 		 788 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.63 
 
 		 801 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.13 
 
 		 572 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.83 
 
 		 814 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.79 
 
 		 785 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.61 
 
 		 573 aa  349  8e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.33 
 
 		 798 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.63 
 
 		 811 aa  346  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.38 
 
 		 570 aa  343  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.74 
 
 		 572 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.43 
 
 		 932 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.04 
 
 		 779 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.15 
 
 		 779 aa  333  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 779 aa  333  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.95 
 
 		 579 aa  332  9e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.68 
 
 		 773 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 779 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 779 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.68 
 
 		 779 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.68 
 
 		 779 aa  331  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.51 
 
 		 779 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.51 
 
 		 779 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.08 
 
 		 573 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.51 
 
 		 779 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.9 
 
 		 573 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.35 
 
 		 564 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 569 aa  324  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.31 
 
 		 599 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.71 
 
 		 566 aa  323  7e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.29 
 
 		 583 aa  322  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.46 
 
 		 732 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.1 
 
 		 568 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.45 
 
 		 566 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  34.85 
 
 		 742 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.63 
 
 		 566 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  33.86 
 
 		 592 aa  314  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.71 
 
 		 857 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  35.68 
 
 		 736 aa  313  5.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.94 
 
 		 574 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.91 
 
 		 579 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 989 aa  310  5e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  34.09 
 
 		 684 aa  307  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.42 
 
 		 977 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.01 
 
 		 883 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.11 
 
 		 865 aa  303  8.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.34 
 
 		 1035 aa  298  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.07 
 
 		 864 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.33 
 
 		 592 aa  297  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 573 aa  296  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  32.93 
 
 		 577 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  32.39 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  32.39 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  32.39 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  32.39 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.54 
 
 		 571 aa  294  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.17 
 
 		 592 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 577 aa  294  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 577 aa  294  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.39 
 
 		 573 aa  294  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  32.21 
 
 		 577 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.21 
 
 		 577 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.89 
 
 		 578 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.58 
 
 		 757 aa  293  6e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.02 
 
 		 576 aa  293  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  32.21 
 
 		 577 aa  293  8e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  32.21 
 
 		 577 aa  292  9e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.97 
 
 		 569 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  32.04 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1602  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.23 
 
 		 823 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.42 
 
 		 911 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.52 
 
 		 571 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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